Campañas de Evaluación Plan TL: Reconocimiento de sustancias en textos médicos en español

La Oficina Técnica de Sanidad del Plan TL organiza PharmaCoNER, la primera campaña competitiva sobre el reconocimiento de fármacos, medicamentos y sustancias químicas en textos médicos en español, como parte del próximo taller BioNLP-OST 2019/EMNLP-IJCNLP 2019 (noviembre de 2019, Hong Kong).

El acceso eficiente a las menciones de fármacos, medicamentos y sustancias químicas es una necesidad apremiante compartida por investigadores biomédicos, clínicos y la industria farmacéutica. El reconocimiento de fármacos y sustancias químicas es un paso imprescindible para la detección posterior de las relaciones de sustancias químicas con otras entidades biomédicas relevantes.

Estamos organizando la primera campaña de evaluación sobre el reconocimiento de fármacos, medicamentos y sustancias químicas en textos médicos en español llamada PharmaCoNER, como parte del próximo taller BioNLP-OST 2019/EMNLP-IJCNLP 2019. Esta tarea abordará la extracción automática de fármacos, medicamentos y sustancias químicas de casos clínicos escritos en español.

La tarea de PharmaCoNER se estructurará en dos sub-tareas:

• Identificación y clasificación de entidades.
• Indización de conceptos.

Web de la Tarea: https://2019.bionlp-ost.org/

Premios

La campaña repartirá 3.400€ en premios a tres clasificados de cada una de las tareas, siendo sus dotaciones:

• Primer clasificado: 1.000€
• Segundo clasificado: 500€
• Tercer clasificado: 200€

Publicaciones

Con el objetivo de recoger los resultados de la investigación, se organizará un número especial de revista que se publicará unos meses después del taller.

Más información en el siguiente enlace

Plazos de Presentación

18 marzo

Lanzamiento del conjunto de muestra y del script de evaluación

26 marzo

Lanzamiento del conjunto de entrenamiento

26 marzo

Lanzamiento del conjunto de desarrollo. Development set released

31 mayo

Lanzamiento del conjunto de prueba (incluido el conjunto background).

25 junio

Final del periodo de evaluación (envío del sistema).

1 julio

Publicación de resultados y conjunto de pruebas con anotaciones de GS

19 julio

Envío de descripción de sistemas

pendiente

Notificación de aceptación (revisión por pares).

pendiente

Envío de artículos (versión final)

2 noviembre

foro BioNLP-OST 2019

[Próximamente se anunciará el programa detallado]

Organización

• Aitor Gonzalez-Agirre, Barcelona Supercomputing Center
• Ander Intxaurrondo, Barcelona Supercomputing Center
• Jose Antonio Lopez-Martin, Hospital 12 de Octubre
• Montserrat Marimon, Barcelona Supercomputing Center
• Jesus Santamaria, Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas
• Felipe Soares, Barcelona Supercomputing Center
• Marta Villegas, Barcelona Supercomputing Center
• Martin Krallinger, Barcelona Supercomputing Center